Στον πυρήνα του ατόμου του υδρογόνου (H2) υπάρχει ένα πρωτόνιο. Αυτό είναι το συνηθισμένο υδρογόνο. Το δευτέριο είναι ένα ισότοπο του υδρογόνου. Στον πυρήνα του έχει ένα πρωτόνιο και ένα νετρόνιο. Ένα μικρό ποσοστό των μορίων του κοινού νερού αποτελείται από άτομα δευτέριου.
Ο πυρήνας του συνηθισμένου άνθρακα (C12) περιέχει 6 πρωτόνια και έξι νετρόνια. Στο ισότοπο του άνθρακα που ονομάζεται άνθρακας 14 (C14), ο πυρήνας περιέχει 6 πρωτόνια και 8 νετρόνια. Ο άνθρακας 14 είναι ραδιενεργός και υπάρχει (σε μικρά ποσοστά) κυρίως στην ατμόσφαιρα.
Ο πυρήνας του συνηθισμένου ουρανίου (ουράνιο 238), περιέχει 92 πρωτόνια και 146 νετρόνια. Το ισότοπο του ουρανίου, που ονομάζεται ουράνιο 235, έχει 92 πρωτόνια και 143 νετρόνια στον πυρήνα του.
